Lors de leur convention du 17 août 1941, les membres de la succursale Immaculée-Conception de la Société Assomption adoptèrent une résolution à l'effet qu'un collège classique devait être érigé dans la région du Madawaska; le 9 novembre 1943, le conseil provincial des Eudistes acceptait d'en prendre la direction. En mars 1944, la Congrégation acquit le terrain de la base militaire d'Edmundston que la défense nationale s'engageait à céder un an après la fin de la guerre. Le 28 février 1946, Mgr Marie-Antoine Roy, l'évêque du nouveau diocèse d'Edmundston, signa un engagement avec les Eudistes pour la fondation du Collège, qui accueillit le 10 septembre suivant ses premiers élèves dans les baraques militaires devenues vacantes avec la fin de la guerre. En mai 1948 commença la construction de l'imposant édifice de pierres qui s'élève toujours sur la colline surplombant la ville d'Edmundston. En 1953, le Collège reçut l'affiliation du Collège Maillet, institution pour jeunes filles de St-Basile, municipalité voisine d'Edmundston. En 1959, fut mis sur pied le Club 200 dont le mandat était de prélever des fonds pour soutenir financièrement l'oeuvre.

A compter de 1960, les commissions d'études mandatées par le Gouvernement du Nouveau-Brunswick et l'Université de Moncton firent des recommandations qui introduisirent de profonds changements dans l'orientation future du Collège, qui avait pris une grande expansion avec la construction d'un gymnase, d'une chapelle, d'un pavillon des sciences, d'une bibliothèque et d'une résidence d'étudiants. Comme ce fut le cas pour le Collège Sacré-Coeur de Bathurst, le Collège Saint-Louis avait suspendu quelques années auparavant la charte universitaire qu'il détenait et s'était affilié à l'Université de Moncton. Le 21 février 1974, la Congrégation des Eudistes cédait à une corporation laïque les propriétés du Collège et se désengageait totalement de son administration.